而与此同时，多铎也率领三万大军，和一百余门各种火炮，向淮河北岸的毫州发动了进攻。毫州、盱眙本是互为犄角，盱眙失守之后，毫州也孤掌难鸣，尽管罗远斌带了两个师来救援盱眙，但吴三桂却派出一支人马，袭取扬州，迫使罗远斌也不得不退兵回援扬州。因此也只好下令毫州的守军，从水路撤离，退守淮安。
毫州、盱眙也就这样被清军攻占，这一战清军也取得了对商家军少有的完全胜利，商家军共计战死了三千五百余人，清军也损失了近三千余人，同时还缴获了各种火炮四十余门，管风琴枪七架、步枪千佘支，当然武器大部份都是在盱眙得到的。而且这时清军己完全控制了整个淮河，罗远斌也只能被迫把部队都撤离到运河以东，依托运河布置防线。
阿济格接报之后，也大喜过望，能打嬴商家军一次，可真不容易，而且在名议上，吴三桂部是受他节制的，因此这里面也有阿济格的一份功劳，同时还缴获了这么多的武器，确实是难得啊。因为清军一直都想弄到商家军的火器样品，好好的研究一下，为什么商家军的火器能够有这么大的威力，这一回可算是捞足了。
当然阿济格也想不了那么远的事，当务之急是尽快攻下南京，现在都巳经是十三曰了，因此也立刻下令，命吴三桂立刻率众渡江，支援江南战场，同时又向大胜关、淳化镇各派出了一万五千人马驻守，保护南京的外围。不过这样一来，清军留守在南京城里的兵力，也只剩四万左右了。
而商毅得知江北的败阵的消息之后，也大吃了一惊，这一来江北的局势可就十分危险了，弄不好整个苏北地区都有失陷的可能。当然造成败阵的主要原因到不是商家军的战斗力不足，还是刘泽清的到戈投降。但影响非常坏，因为算起来这还是商家军第一次完败于清军，要不是成进刚刚取得了南京外线的大胜，对商家军的士气，可是一次很大的打击。而当务之急是加强宣传，尽量多挽回一点损失。
至于被清军缴获的武器，那也是没办法的事了，只要是还在和清军交战，这种事情就很难避免得了，能拖到现在，己经很不错了。而且由于关建的技术雷汞还没有泄露出去，因此清军就算仿制，效果也有限。
因此商毅也立刻下令到扬州，安慰罗远斌，这次败仗的主要责任并不在他，但一定要吸取考训，组织好后面的战斗，必耍的时候，可以放并淮安，但一定要守住扬州，这可是苏北的最后阵线，也命杭州统战部，给江北调去两个旅，以加强江北的兵力。又命在鲁南的周少桓，适当向清军发动几次中等规模的进攻，吸引多铎的注意力，减少苏北的压力。同时告戒全军，以后再遇到来历不明白的军队，那怕就明军，也要提高警惕，详细盘问，不能轻易放行，毕竟在这个时候，除了自己人，谁也靠不住。
当然消除这一败的影响，最好的方式就是在江南战场再打几个胜仗，一方面可以用胜利来提高全军的士气，也加强宣传的题材，另一方面也是迫使清军从江北调动兵力，増援江南战场，从而也可以减轻江北战场的压力。而且现在的江南战场，也巳经出现了新的战机。
首先是在南京城里，清军的兵力己不足四万，而南京外围的守军在成进的压迫之下，都不能动弹，自己完全可以在南京城里发动几次进攻，给阿济格施加压力。同时智顺王尚可喜巳经率军东进，对善于打伏击战的商家军来说，这又是一个好机会。
于是商毅立刻给成进下令，让他准备在尚可喜进军的途中，伏击尚可喜的人马。同时在南京城内，商家军也开始向皇城发动进攻。
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